oncotomskСибирский онкологический журналSiberian journal of oncology1814-48612312-3168Tomsk National Research Medical Сепtеr of the Russian Academy of Sciences10.21294/1814-4861-2022-21-4-72-79oncotomsk-2235Research ArticleЛАБОРАТОРНЫЕ И ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯLABORATORY AND EXPERIMENTAL STUDIESНовая мутация в гене PALB2, ассоциированная с наследственным раком молочной железы у молодой пациентки, принадлежащей к якутской этнической группеA novel germline mutation of the PALB2 gene in a young Yakut breast cancer womanhttps://orcid.org/0000-0003-0051-8814ГервасП. А.GervasP. A.

Гервас Полина Анатольевна - кандидат медицинских наук, научный сотрудник лаборатории молекулярной онкологии и иммунологии, руководитель группы молекулярно-генетических методов исследований в референсном центре.

634009, Томск, пер. Кооперативный, 5.

SPIN-код: 2934-7970. Researcher ID (WOS): C-5846-2012. Author ID (Scopus): 13613767400.

Polina A. Gervas - MD, PhD, Researcher at the Laboratory of Molecular Oncology and Immunology, Head of the group of molecular-genetic research methods of the reference center, Cancer Research Institute, Тomsk National Research Medical Center, Russian Academy of Sciences.

5, Kooperativny St., 634009, Tomsk.

Researcher ID (WOS): C-5846-2012. Author ID (Scopus): 13613767400.

pgervas@yandex.ruhttps://orcid.org/0000-0002-1475-1185МолоковА. Ю.MolokovA. Yu.

Молоков Алексей Юрьевич - младший научный сотрудник лаборатории молекулярной онкологии и иммунологии.

634009, Томск, пер. Кооперативный, 5.

SPIN-код: 1347-8410. Researcher ID (WOS): AAF-7302-2021. Author ID (Scopus): 57217493727.

Aleksey Yu. Molokov - Junior Researcher at the Laboratory of Molecular Oncology and Immunology, Cancer Research Institute, Тomsk National Research Medical Center, Russian Academy of Sciences.

5, Kooperativny St., 634009, Tomsk.

Researcher ID (WOS): AAF-7302-2021. Author ID (Scopus): 57217493727.

https://orcid.org/0000-0001-6568-6339ЗарубинА. А.ZarubinA. A.

Зарубин Алексей Андреевич - аспирант, младший научный сотрудник лаборатории геномики орфанных болезней.

634050, Томск, ул. Набережная Ушайки, 10.

SPIN-код: 7568-0098. Researcher ID (WOS): H-7476-2017. Author ID (Scopus): 57204453703.

Aleksei A. Zarubin - Postgraduate, Junior Researcher at the Laboratory researcher of the Evolutionary Genetics Laboratory, Research Institute of Medical Genetics, Tomsk National Research Medical Center, Russian Academy of Science.

10, Nab. Ushaiki, 634050, Tomsk.

Researcher ID (WOS): H-7476-2017. Author ID (Scopus): 57204453703.

ИвановаА. A.IvanovaA. A.

Иванова Анна Aлександровна - кандидат медицинских наук, научный сотрудник лаборатории молекулярной онкологии и иммунологии, руководитель группы молекулярно-генетических методов исследований в референсном центре.

634009, Томск, пер. Кооперативный, 5.

Anna A. Ivanova - MD, PhD, Researcher at the Laboratory of Molecular Oncology and Immunology, head of the group of molecular-genetic research methods of the reference center, Cancer Research Institute, Тomsk National Research Medical Center, Russian Academy of Sciences.

5, Kooperativny St., 634009, Tomsk.

https://orcid.org/0000-0003-3385-9471ТихоновД. Г.TikhonovD. G.

Тихонов Дмитрий Гаврильевич - доктор медицинских наук, профессор.

677007, Якутск, ул. Кулаковского, 42.

Researcher ID (WOS): C-1032-2014. Author ID (Scopus): 7006659217.

Dmitrii G. Tikhonov - MD, Professor, M.K. Ammosov North-Eastern Federal University.

42, Kulakovsky St., 677007, Yakutsk.

Researcher ID (WOS): C-1032-2014. Author ID (Scopus): 7006659217.

КиприяноваН. С.KipriyanovaN. S.

Киприянова Надежда Cидоровна - доктор медицинских наук, главный внештатный онколог г. Якутска, профессор кафедры техносферной безопасности.

677007, Якутск, ул. Кулаковского, 42.

Nadezda S. Kipriyanova - MD, DSc, Chief Freelance Oncologist in Yakutsk, Professor of the Department of Technosphere Safety, M.K. Ammosov North-Eastern Federal University.

42, Kulakovsky St., 677007, Yakutsk.

https://orcid.org/0000-0003-4610-7105ЕгоровА. Н.EgorovA. N.

Егоров Андрей Николаевич - аспирант Института естественных наук, лаборант Научно-исследовательской лаборатории клеточных технологий и регенеративной медицины.

677007, Якутск, ул. Кулаковского, 42.

Andrew N. Egorov - Postgraduate, Institute of Natural Sciences, laboratory assistant at the Research Laboratory of Cell Technologies and Regenerative Medicine, M.K. Ammosov North-Eastern Federal University.

42, Kulakovsky St., 677007, Yakutsk.

https://orcid.org/0000-0003-3536-8473ЖуйковаЛ. Д.ZhuikovaL. D.

Жуйкова Лилия Дмитриевна - доктор медицинских наук, заведующая лабораторией эпидемиологии.

634009, Томск, пер. Кооперативный, 5.

SPIN-код: 3260-1308. Researcher ID (WOS): C-8293-2012. Author ID (Scopus): 56626111900.

Lilia D. Zhuikova - MD, DSc, Head of the Laboratory of Epidemiology, Cancer Research Institute, Тomsk National Research Medical Center, Russian Academy of Sciences.

5, Kooperativny St., 634009, Tomsk.

Researcher ID (WOS):  C-8293-2012. Author ID (Scopus): 56626111900.

https://orcid.org/0000-0002-0011-8370ШеферН. А.SheferN. A.

Шефер Николай Анатольевич - кандидат медицинских наук, врач-онколог, Томский областной онкологический диспансер; ассистент кафедры хирургии с курсом мобилизационной подготовки и медицины катастроф, СибГМУ Минздрава России.

634050, Томск, пр. Ленина, 115; 634050, Томск, Московский тракт, 2.

SPIN-код: 3662-7399.

Nikolay A. Shefer - MD, PhD, Oncologist, Tomsk Regional Oncological Dispensary; assistant of the Department of Surgery with a course of mobilization training and disaster medicine, Siberian State Medical University of the Ministry of Health of Russia.

115, Lenina Ave., 634050, Tomsk; 2, Moskovsky Tract, 634050, Tomsk.

https://orcid.org/0000-0002-5674-0177ТопольницкийЕ. Б.TopolnitskiyE. B.

Топольницкий Евгений Богданович - доктор медицинских наук, профессор кафедры хирургии с курсом мобилизационной подготовки и медицины катастроф.

634050, Томск, Московский тракт, 2.

SPIN-код: 6744-9541.

Evgenii B. Topolnitskiy - MD, DSc, Professor of the Department of Surgery with a course of mobilization training and disaster medicine, Siberian State Medical University of the Ministry of Health of Russia.

2, Moskovsky Tract, 634050, Tomsk.

БелявскаяВ. А.BelyavskayaV. A.

Белявская Валентина Александровна - доктор биологических наук, профессор, ведущий научный сотрудник.

630559, Новосибирск, пос. Кольцово.

Valentina A. Belyavskaya - DSc, Professor, Leading Researcher, Research Center of Virology and Biotechnology, Vector.

630559, Koltsovo, Novosibirsk.

https://orcid.org/0000-0003-3507-0095ПисареваЛ. Ф.PisarevaL. F.

Писарева Любовь Филипповна - доктор медицинских наук, профессор.

634009, Томск, пер. Кооперативный, 5.

SPIN-код: 3529-0202. Researcher ID (WOS): D-2353-2012. Author ID (Scopus): 7003646806.

Lubov F. Pisareva - MD, DSc, Professor, Cancer Research Institute, Тomsk National Research Medical Center, Russian Academy of Sciences.

5, Kooperativny St., 634009, Tomsk.

Researcher ID (WOS): D-2353-2012. Author ID (Scopus): 7003646806.

https://orcid.org/0000-0002-3651-0665ЧойнзоновЕ. Л.ChoynzonovE. L.

Чойнзонов Евгений Лхамацыренович - доктор медицинских наук, профессор, академик РАН, директор НИИ онкологии, Томский НИМЦ РАН; заведующий кафедрой онкологии, СибГМУ Минздрава России.

634009, Томск, пер. Кооперативный, 5; 634050, Томск, Московский тракт, 2.

SPIN-код: 2240-8730. Researcher ID (WOS): P-1470-2014. Author ID (Scopus): 6603352329.

Evgeny L. Choynzonov - MD, DSc, Professor, Full Member of the Russian Academy of Sciences, Director, Cancer Research Institute, Тomsk National Research Medical Center, Russian Academy of Sciences; Head of Oncology Department, Siberian State Medical University of the Ministry of Health of Russia.

5, Kooperativny St., 634009, Tomsk; 2, Moskovsky Tract, 634050, Tomsk.

Researcher ID (WOS): P-1470-2014. Author ID (Scopus): 6603352329.

https://orcid.org/0000-0003-1526-9013ЧердынцеваН. В.CherdyntsevaN. V.

Чердынцева Надежда Викторовна - доктор биологических наук, профессор, член-корреспондент РАН, заведующая лабораторией молекулярной онкологии и иммунологии, заместитель директора НИИ онкологии, Томский НИМЦ РАН; научный сотрудник лаборатории генетических технологий, СибГМУ Минздрава России.

634009, Томск, пер. Кооперативный, 5; 634050, Томск, Московский тракт, 2.

SPIN-код: 5344-0990. Researcher ID (WOS): C-7943-2012. Author ID (Scopus): 6603911744.

Nadezda V. Cherdyntseva - DSc, Professor, Corresponding Member of the Russian Academy of Sciences, Head of the Department of Molecular Oncology and Immunology, Deputy Director for Science, Cancer Research Institute, Тomsk National Research Medical Center, Russian Academy of Sciences; Researcher of the Laboratory of Genetic Technologies, Siberian State Medical University of the Ministry of Health of Russia.

5, Kooperativny St., 634009, Tomsk; 2, Moskovsky Tract, 634050, Tomsk.

Researcher ID (WOS): C-7943-2012. Author ID (Scopus): 6603911744.

Научно-исследовательский институт онкологии, Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наукРоссияCancer Research Institute, Tomsk National Research Medical Center, Russian Academy of SciencesRussian FederationНаучно-исследовательский институт медицинской генетики, Томский национальный исследовательский медицинский центр, Российская академия наукРоссияResearch Institute of Medical Genetics, Tomsk National Research Medical Center, Russian Academy of ScienceRussian FederationСеверо-Восточный федеральный университет им. М.К. АммосоваРоссияM.K. Ammosov North-Eastern Federal UniversityRussian FederationТомский областной онкологический диспансер; Сибирский государственный медицинский университет Минздрава РоссииРоссияTomsk Regional Oncological Dispensary; Siberian State Medical University of The Ministry of Health of RussiaRussian FederationСибирский государственный медицинский университет Минздрава РоссииРоссияSiberian State Medical University of The Ministry of Health of RussiaRussian FederationГосударственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор»РоссияResearch Center of Virology and Biotechnology, VectorRussian FederationНаучно-исследовательский институт онкологии, Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наукРоссияCancer Research Institute, Тomsk National Research Medical Center, Russian Academy of SciencesRussian FederationНаучно-исследовательский институт онкологии, Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук; Сибирский государственный медицинский университет Минздрава РоссииРоссияCancer Research Institute, Tomsk National Research Medical Center, Russian Academy of Sciences; Siberian State Medical University of The Ministry of Health of RussiaRussian Federation2022010920222147279Copyright © Гервас П.А., Молоков А.Ю., Зарубин А.А., Иванова А.A., Тихонов Д.Г., Киприянова Н.С., Егоров А.Н., Жуйкова Л.Д., Шефер Н.А., Топольницкий Е.Б., Белявская В.А., Писарева Л.Ф., Чойнзонов Е.Л., Чердынцева Н.В., 20222022Гервас П.А., Молоков А.Ю., Зарубин А.А., Иванова А.A., Тихонов Д.Г., Киприянова Н.С., Егоров А.Н., Жуйкова Л.Д., Шефер Н.А., Топольницкий Е.Б., Белявская В.А., Писарева Л.Ф., Чойнзонов Е.Л., Чердынцева Н.В.Gervas P.A., Molokov A.Y., Zarubin A.A., Ivanova A.A., Tikhonov D.G., Kipriyanova N.S., Egorov A.N., Zhuikova L.D., Shefer N.A., Topolnitskiy E.B., Belyavskaya V.A., Pisareva L.F., Choynzonov E.L., Cherdyntseva N.V.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.siboncoj.ru/jour/article/view/2235

Актуальность. Рак молочной железы занимает лидирующие позиции по уровню заболеваемости во всем мире. Ген онкосупрессор PALB2 наряду с такими генами, как BRCA1, BRCA2, вовлечен в процессы репарации поврежденной ДНК. Частота встречаемости герминальных мутаций гена PALB2 при раке молочной железы и семейных случаях рака поджелудочной железы составляет приблизительно 1–2 % и 3–4 % соответственно. Представлен клинический случай 39-летней женщины, принадлежащей к якутской этнической группе, с диагнозом рак молочной железы с семейной историей рака поджелудочной железы. Материал и методы. Геномная ДНК выделена из периферической крови, ДНК-библиотеки приготавливали с использованием набора Hereditary Cancer Solution™ (Sophia Genetics, Швейцария) для изучения статуса 27 генов (ATM, APC, BARD1, BRCA1, BRCA2, BRIP1, CDH1, CHEK2, EPCAM, FAM175A, MLH1, MRE11A, MSH2, MSH6, MUTYH, NBN, PALB2, PIK3CA, PMS2, PMS2CL, PTEN, RAD50, RAD51C, RAD51D, STK11, TP53 и XRCC2). Секвенирование (2 × 150 п.н.) проводилось с использованием системы NextSeq 500 (Illumina, США). Результаты. По результатам биоинформатического анализа данных NGS у 39-летней женщины, принадлежащей к якутской этнической группе, с диагнозом рак молочной железы с семейной историей рака поджелудочной железы обнаружена новая герминальная мутация гена PALB2 со сдвигом рамки считывания (NM_024675: Exon1: c.47delA: p.K16FS). В соответствии с dbPubmed ClinVar новая мутация гена PALB2 расположена в том же кодоне, где ранее была описана, вероятно патогенная, мутация сайта сплайсинга (NM_024675.3: Exon1: c.48+1delG), вовлеченная в патогенез наследственных форм рака молочной железы и яичника. Заключение. Впервые у 39-летней женщины, принадлежащей к якутской этнической группе, с диагнозом рак молочной железы и с семейной историей рака поджелудочной железы обнаружена новая, вероятно патогенная, герминальная мутация гена PALB2 со сдвигом рамки считывания (NM_024675: Exon1: c.47delA: p.K16FS).

Background. Breast cancer (BC) is the most common female malignancy worldwide. Partner And Localizer of BRCA2 gene (PALB2) is directly involved in DNA damage response. Germline mutation in PALB2 has been identified in breast cancer and familial pancreatic cancer cases, accounting for approximately 1–2% and 3–4%, respectively. The goal of this report was to describe new PALB2 mutation in a young Yakut breast cancer patient with family history of cancer. Material and Methods. Genomic DNA were isolated from blood samples and used to prepare libraries using a capture-based target enrichment kit, Hereditary Cancer Solution™ (SOP HiA GE NETICS , Switzerland), covering 27 genes (ATM, APC, BARD1, BRCA1, BRCA2, BRIP1, CDH1, CHEK2, EPCAM, FAM175A, MLH1, MRE11A, MSH2, MSH6, MUTYH, NBN, PALB2, PIK3CA, PMS2, PMS2CL, PTEN, RAD50, RAD51C, RAD51D, STK11, TP53 and XRCC2). Paired-end sequencing (2 × 150 bp) was conducted using NextSeq 500 system (Illumina, USA ). Results. Here we describe a case of a never-before-reported mutation in the PALB2 gene that led to the early onset breast cancer. We report the case of a 39-year-old breast cancer Yakut woman with a family history of pancreatic cancer. Bioinformatics analysis of the NGS data revealed the presence of the new PALB2 gene germinal frameshift deletion (NM_024675:exon1:c.47delA:p.K16fs). In accordance with dbPubMed ClinVar, new mutation is located in codon of the PALB2 gene, where the likely pathogenic donor splice site mutation (NM_024675.3:c.48+1delG) associated with hereditary cancer-predisposing syndrome has been earlier described. Conclusion. We found a new never-before-reported mutation in PALB2 gene, which probably associated with early onset breast cancer in Yakut indigenous women with a family history of pancreatic cancer.

наследственные мутациирак молочной железыэтносы России азиатского происхожденияякутыPALB2germline mutationbreast cancerAsian ancestry ethnic groups in RussiaYakutPALB2Исследование выполнено при финансовой поддержке РНФ, проект № 22-25-20032; Оборудование ЦКП «Медицинская геномика» Томского НИМЦ.The study was funded by the Russian Science Foundation, project № 22-25-20032; The Core Facility «Medical genomics», Tomsk NRMC.ReferencesGifoni A.C.L.V.C., Gifoni M.A.C., Wotroba C.M., Palmero E.I., Costa E.L.V., Dos Santos W., Achatz M.I. Hereditary Breast Cancer in the Brazilian State of Ceará (The CHANCE Cohort): Higher-Than-Expected Prevalence of Recurrent Germline Pathogenic Variants. Front Oncol. 2022; 12. doi: 10.3389/fonc.2022.932957.Gifoni A.C.L.V.C., Gifoni M.A.C., Wotroba C.M., Palmero E.I., Costa E.L.V., Dos Santos W., Achatz M.I. Hereditary Breast Cancer in the Brazilian State of Ceará (The CHANCE Cohort): Higher-Than-Expected Prevalence of Recurrent Germline Pathogenic Variants. Front Oncol. 2022; 12. doi: 10.3389/fonc.2022.932957.Plon S.E., Eccles D.M., Easton D., Foulkes W.D., Genuardi M., Greenblatt M.S., Hogervorst F.B., Hoogerbrugge N., Spurdle A.B., Tavtigian S.V.; IARC Unclassified Genetic Variants Working Group. Sequence variant classification and reporting: recommendations for improving the interpretation of cancer susceptibility genetic test results. Hum Mutat. 2008; 29(11): 1282–91. doi: 10.1002/humu.20880.Plon S.E., Eccles D.M., Easton D., Foulkes W.D., Genuardi M., Greenblatt M.S., Hogervorst F.B., Hoogerbrugge N., Spurdle A.B., Tavtigian S.V.; IARC Unclassified Genetic Variants Working Group. Sequence variant classification and reporting: recommendations for improving the interpretation of cancer susceptibility genetic test results. Hum Mutat. 2008; 29(11): 1282–91. doi: 10.1002/humu.20880.Richards S., Aziz N., Bale S., Bick D., Das S., Gastier-Foster J., Grody W.W., Hegde M., Lyon E., Spector E., Voelkerding K., Rehm H.L.; ACMG Laboratory Quality Assurance Committee. Standards and guidelines for the interpretation of sequence variants: a joint consensus recommendation of the American College of Medical Genetics and Genomics and the Association for Molecular Pathology. Genet Med. 2015; 17(5): 405–24. doi: 10.1038/gim.2015.30.Richards S., Aziz N., Bale S., Bick D., Das S., Gastier-Foster J., Grody W.W., Hegde M., Lyon E., Spector E., Voelkerding K., Rehm H.L.; ACMG Laboratory Quality Assurance Committee. Standards and guidelines for the interpretation of sequence variants: a joint consensus recommendation of the American College of Medical Genetics and Genomics and the Association for Molecular Pathology. Genet Med. 2015; 17(5): 405–24. doi: 10.1038/gim.2015.30.Kononova S., Vinokurova D., Barashkov N.A., Semenova A., Sofronova S., Oksana S., Tatiana D., Struchkov V., Burtseva T., Romanova A., Fedorova S. The attitude of young people in the city of Yakutsk to DNA-testing. Int J Circumpolar Health. 2021; 80(1). doi: 10.1080/22423982.2021.1973697.Kononova S., Vinokurova D., Barashkov N.A., Semenova A., Sofronova S., Oksana S., Tatiana D., Struchkov V., Burtseva T., Romanova A., Fedorova S. The attitude of young people in the city of Yakutsk to DNA-testing. Int J Circumpolar Health. 2021; 80(1). doi: 10.1080/22423982.2021.1973697.Kirillina M.P., Loskutova K.S., Lushnikova E.L., Nepomnyashchikh L.M. Expression of molecular biological markers in breast cancer under conditions of the Sakha Republic (Yakutia). Bull Exp Biol Med. 2014; 157(5): 623–7. doi: 10.1007/s10517-014-2630-x.Kirillina M.P., Loskutova K.S., Lushnikova E.L., Nepomnyashchikh L.M. Expression of molecular biological markers in breast cancer under conditions of the Sakha Republic (Yakutia). Bull Exp Biol Med. 2014; 157(5): 623–7. doi: 10.1007/s10517-014-2630-x.Писарева Л.Ф., Одинцова И.Н., Иванов П.М., Николаева Т.И. Особенности заболеваемости раком молочной железы коренного и пришлого населения Республики Саха (Якутия). Сибирский онкологический журнал. 2007; (3): 69–72.Pisareva L.F., Odintsova I.N., Ivanov P.M., Nikolaeva T.I. Breast cancer incidence among indigenous peoples and newcomers in Sakha republic (Yakutia). Siberian Journal of Oncology. 2007; (3): 69–72. (in Russian).Eccles D.M. Hereditary cancer: guidelines in clinical practice. Breast and ovarian cancer genetics. Ann Oncol. 2004; 15(4): 133–8. doi: 10.1093/annonc/mdh917.Eccles D.M. Hereditary cancer: guidelines in clinical practice. Breast and ovarian cancer genetics. Ann Oncol. 2004; 15(4): 133–8. doi: 10.1093/annonc/mdh917.Slatko B.E., Gardner A.F., Ausubel F.M. Overview of Next-Generation Sequencing Technologies. Curr Protoc Mol Biol. 2018; 122(1): 59. doi: 10.1002/cpmb.59.Slatko B.E., Gardner A.F., Ausubel F.M. Overview of Next-Generation Sequencing Technologies. Curr Protoc Mol Biol. 2018; 122(1): 59. doi: 10.1002/cpmb.59.Van der Auwera G.A., Carneiro M.O., Hartl C., Poplin R., Del Angel G., Levy-Moonshine A., Jordan T., Shakir K., Roazen D., Thibault J., Banks E., Garimella, K.V., Altshuler D., Gabriel S., DePristo M.A. From FastQ data to high confidence variant calls: the Genome Analysis Toolkit best practices pipeline, Curr Protoc Bioinformatics. 2013; 43(1110): 11.10.1–11.10.33. doi: 10.1002/0471250953.bi1110s43.Van der Auwera G.A., Carneiro M.O., Hartl C., Poplin R., Del Angel G., Levy-Moonshine A., Jordan T., Shakir K., Roazen D., Thibault J., Banks E., Garimella, K.V., Altshuler D., Gabriel S., DePristo M.A. From FastQ data to high confidence variant calls: the Genome Analysis Toolkit best practices pipeline, Curr Protoc Bioinformatics. 2013; 43(1110): 11.10.1–11.10.33. doi: 10.1002/0471250953.bi1110s43.DePristo M.A., Banks E., Poplin R., Garimella K.V., Maguire J.R., Hartl C., Philippakis A.A., del Angel G., Rivas M.A., Hanna M., McKenna A., Fennell T.J., Kernytsky A.M., Sivachenko A.Y., Cibulskis K., Gabriel S.B., Altshuler D., Daly M.J. A framework for variation discovery and genotyping using next-generation DNA sequencing data. Nature genetics. 2011; 43(5): 491–8. doi: 10.1038/ng.806.DePristo M.A., Banks E., Poplin R., Garimella K.V., Maguire J.R., Hartl C., Philippakis A.A., del Angel G., Rivas M.A., Hanna M., McKenna A., Fennell T.J., Kernytsky A.M., Sivachenko A.Y., Cibulskis K., Gabriel S.B., Altshuler D., Daly M.J. A framework for variation discovery and genotyping using next-generation DNA sequencing data. Nature genetics. 2011; 43(5): 491–8. doi: 10.1038/ng.806.McKenna A., Hanna M., Banks E., Sivachenko A., Cibulskis K., Kernytsky A., Garimella K., Altshuler D., Gabriel S., Daly M., DePristo M.A. The Genome Analysis Toolkit: a MapReduce framework for analyzing next-generation DNA sequencing data. Genome Res. 2010; 20(9): 1297–303. doi: 10.1101/gr.107524.110.McKenna A., Hanna M., Banks E., Sivachenko A., Cibulskis K., Kernytsky A., Garimella K., Altshuler D., Gabriel S., Daly M., DePristo M.A. The Genome Analysis Toolkit: a MapReduce framework for analyzing next-generation DNA sequencing data. Genome Res. 2010; 20(9): 1297–303. doi: 10.1101/gr.107524.110.Adzhubei I.A., Schmidt S., Peshkin L., Ramensky V.E., Gerasimova A., Bork P., Kondrashov A.S., Sunyaev S.R. A method and server for predicting damaging missense mutations. Nat Methods. 2010; 7(4): 248–9. doi: 10.1038/nmeth0410-248.Adzhubei I.A., Schmidt S., Peshkin L., Ramensky V.E., Gerasimova A., Bork P., Kondrashov A.S., Sunyaev S.R. A method and server for predicting damaging missense mutations. Nat Methods. 2010; 7(4): 248–9. doi: 10.1038/nmeth0410-248.Schwarz J.M., Cooper D.N., Schuelke M., Seelow D. Mutation-Taster2: mutation prediction for the deep-sequencing age. Nat Methods. 2014; 11(4): 361–2. doi: 10.1038/nmeth.2890.Schwarz J.M., Cooper D.N., Schuelke M., Seelow D. Mutation-Taster2: mutation prediction for the deep-sequencing age. Nat Methods. 2014; 11(4): 361–2. doi: 10.1038/nmeth.2890.Kumar P., Henikoff S., Ng P.C. Predicting the effects of coding non-synonymous variants on protein function using the SIFT algorithm. Nat Protoc. 2009; 4(7): 1073–81. doi: 10.1038/nprot.2009.86.Kumar P., Henikoff S., Ng P.C. Predicting the effects of coding non-synonymous variants on protein function using the SIFT algorithm. Nat Protoc. 2009; 4(7): 1073–81. doi: 10.1038/nprot.2009.86.Richards C.S., Bale S., Bellissimo D.B., Das S., Grody W.W., Hegde M.R., Lyon E., Ward B.E.; Molecular Subcommittee of the ACMG Laboratory Quality Assurance Committee. ACMG recommendations for standards for interpretation and reporting of sequence variations: Revisions 2007. Genet Med. 2008; 10(4): 294–300. doi: 10.1097/GIM.0b013e31816b5cae.Richards C.S., Bale S., Bellissimo D.B., Das S., Grody W.W., Hegde M.R., Lyon E., Ward B.E.; Molecular Subcommittee of the ACMG Laboratory Quality Assurance Committee. ACMG recommendations for standards for interpretation and reporting of sequence variations: Revisions 2007. Genet Med. 2008; 10(4): 294–300. doi: 10.1097/GIM.0b013e31816b5cae.Hofstatter E.W., Domchek S.M., Miron A., Garber J., Wang M., Componeschi K., Boghossian L., Miron P.L., Nathanson K.L., Tung N. PALB2 mutations in familial breast and pancreatic cancer. Fam Cancer. 2011; 10(2): 225–31. doi: 10.1007/s10689-011-9426-1.Hofstatter E.W., Domchek S.M., Miron A., Garber J., Wang M., Componeschi K., Boghossian L., Miron P.L., Nathanson K.L., Tung N. PALB2 mutations in familial breast and pancreatic cancer. Fam Cancer. 2011; 10(2): 225–31. doi: 10.1007/s10689-011-9426-1.Tischkowitz M.D., Sabbaghian N., Hamel N., Borgida A., Rosner C., Taherian N., Srivastava A., Holter S., Rothenmund H., Ghadirian P., Foulkes W.D., Gallinger S. Analysis of the gene coding for the BRCA2-interacting protein PALB2 in familial and sporadic pancreatic cancer. Gastroenterology. 2009; 137(3): 1183–6. doi: 10.1053/j.gastro.2009.06.055.Tischkowitz M.D., Sabbaghian N., Hamel N., Borgida A., Rosner C., Taherian N., Srivastava A., Holter S., Rothenmund H., Ghadirian P., Foulkes W.D., Gallinger S. Analysis of the gene coding for the BRCA2-interacting protein PALB2 in familial and sporadic pancreatic cancer. Gastroenterology. 2009; 137(3): 1183–6. doi: 10.1053/j.gastro.2009.06.055.Jones S., Hruban R.H., Kamiyama M., Borges M., Zhang X., Parsons D.W., Lin J.C., Palmisano E., Brune K., Jaffee E.M., Iacobuzio-Donahue C.A., Maitra A., Parmigiani G., Kern S.E., Velculescu V.E., Kinzler K.W., Vogelstein B., Eshleman J.R., Goggins M., Klein A.P. Exomic sequencing identifies PALB2 as a pancreatic cancer susceptibility gene. Science. 2009; 324(5924): 217. doi: 10.1126/science.1171202.Jones S., Hruban R.H., Kamiyama M., Borges M., Zhang X., Parsons D.W., Lin J.C., Palmisano E., Brune K., Jaffee E.M., Iacobuzio-Donahue C.A., Maitra A., Parmigiani G., Kern S.E., Velculescu V.E., Kinzler K.W., Vogelstein B., Eshleman J.R., Goggins M., Klein A.P. Exomic sequencing identifies PALB2 as a pancreatic cancer susceptibility gene. Science. 2009; 324(5924): 217. doi: 10.1126/science.1171202.Slater E.P., Langer P., Niemczyk E., Strauch K., Butler J., Habbe N., Neoptolemos J.P., Greenhalf W., Bartsch D.K. PALB2 mutations in European familial pancreatic cancer families. Clin Genet. 2010; 78(5): 490–4. doi: 10.1111/j.1399-0004.2010.01425.x.Slater E.P., Langer P., Niemczyk E., Strauch K., Butler J., Habbe N., Neoptolemos J.P., Greenhalf W., Bartsch D.K. PALB2 mutations in European familial pancreatic cancer families. Clin Genet. 2010; 78(5): 490–4. doi: 10.1111/j.1399-0004.2010.01425.x.Hanenberg H., Andreassen P.R. PALB2 (partner and localizer of BRCA2). Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. 2018; 22(12): 484–90. doi: 10.4267/2042/69016.Hanenberg H., Andreassen P.R. PALB2 (partner and localizer of BRCA2). Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. 2018; 22(12): 484–90. doi: 10.4267/2042/69016.Practice Bulletin No 182: Hereditary Breast and Ovarian Cancer Syndrome. Obstet Gynecol. 2017; 130(3): 110–26. doi: 10.1097/AOG.0000000000002296.Practice Bulletin No 182: Hereditary Breast and Ovarian Cancer Syndrome. Obstet Gynecol. 2017; 130(3): 110–26. doi: 10.1097/AOG.0000000000002296.Grellety T., Peyraud F., Sevenet N., Tredan O., Dohollou N., Barouk-Simonet E., Kind M., Longy M., Blay J.Y., Italiano A. Dramatic response to PARP inhibition in a PALB2-mutated breast cancer: moving beyond BRCA. Ann Oncol. 2020; 31(6): 822–3. doi: 10.1016/j.annonc.2020.03.283.Grellety T., Peyraud F., Sevenet N., Tredan O., Dohollou N., Barouk-Simonet E., Kind M., Longy M., Blay J.Y., Italiano A. Dramatic response to PARP inhibition in a PALB2-mutated breast cancer: moving beyond BRCA. Ann Oncol. 2020; 31(6): 822–3. doi: 10.1016/j.annonc.2020.03.283.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.