oncotomskСибирский онкологический журналSiberian journal of oncology1814-48612312-3168Tomsk National Research Medical Сепtеr of the Russian Academy of Sciences10.21294/1814-4861-2018-17-1-11-18oncotomsk-665Research ArticleКЛИНИЧЕСКИЕ ИССЛЕДОВАНИЯCLINICAL STUDIESМЕСТО АНАЭРОБНЫХ МИКРООРГАНИЗМОВ РОДА VEILLONELLA В ИНФЕКЦИОННЫХ ОСЛОЖНЕНИЯХ У ОНКОЛОГИЧЕСКИХ БОЛЬНЫХROLE OF GRAM-NEGATIVE ANAEROBIC COCCI BELONGING TO THE GENUS VEILLONELLA IN INFECTIOUS COMPLICATIONS IN CANCER PATIENTSТерещенкоИ. В.TereshchenkoI. V.

Терещенко Инна Васильевна - научный сотрудник лаборатории микробиологической диагностики и лечения инфекций в онкологии, SPIN-код: 3185-9586.

Inna V. Tereshchenko, Research fellow, Laboratory of Microbiological Diagnostics and Management of Infections in Cancer Patients, SPIN-code: 3185-9586.

23, Kashirskoe shosse, 115478-Moscow

in.ter68@inbox.ruГригорьевскаяЗ. В.GrigorievskayaZ. V.

Григорьевская Злата Валерьевна - доктор медицинских наук, старший научный сотрудник лаборатории микробиологической диагностики и лечения инфекций в онкологии, SPIN-код: 4416-5191.

115478, Москва, Каширское шоссе, 23

Zlata V. Grigorievskaya - MD, DSc, Senior Researcher, Laboratory of Microbiological Diagnostics and Management of Infections in Cancer Patients, SPIN-code: 4416-5191.

23, Kashirskoe shosse, 115478-Moscow

zlatadoc@list.ruПетуховаИ. Н.PetukhovaI. N.

Петухова Ирина Николаевна - доктор медицинских наук, ведущий научный сотрудник лаборатории микробиологической диагностики и лечения инфекций в онкологии, SPIN-код: 1265-2875.

115478, Москва, Каширское шоссе, 23

Irina N. Petukhova - MD, DSc, Leading Research Scientist, Laboratory of Microbiological Diagnostics and Management of Infections in Cancer Patients, SPIN-code: 1265-2875.

irinapet@list.ruШильниковаИ. И.ShilnikovaI. I.

Шильникова Ирина Ивановна - кандидат биологических наук, старший научный сотрудник лаборатории микробиологической диагностики и лечения инфекций в онкологии, SPIN-код: 9400-6222.

115478, Москва, Каширское шоссе, 23

Irina I. Shilnikova - MD, DSc, Senior Researcher, Laboratory of Microbiological Diagnostics and Management of Infections in Cancer Patients, SPIN-code: 9400-6222.

iish54@mail.ruГригорьевскийЕ. Д.GrigorievskyЕ. D.

Григорьевский Евгений Дмитриевич - студент 6-го курса лечебного факультета.

119991, Москва, ул. Большая Пироговская, 2, стр. 4

Evgeny D. Grigorievsky - 6-th year student.

2/4, Bol’shaya Pirogovskaya Str., 119991-Moscow

mrjake916@gmail.comТерещенкоО. В.TereshchenkoО. V.

Терещенко Олеся Викторовна - студентка 5-го курса лечебного факультета.

117997, Москва, ул. Островитянова, 1

Olesya V. Tereshchenko, 5-th year student.

invrtdforest@gmail.comАгиноваВ. В.AginovaV. V.

Агинова Виктория Викторовна - преподаватель профессионального модуля «Проведение лабораторных микробиологических и иммунологических исследований».

115478, Москва, Каширское шоссе, 23; 1127206, Москва, Чуксин тупик, 6

Viktoria V. Aginova – Lecturer MC № 1.

23, Kashirskoe shosse, 115478-Moscow; 6, Chuksin tupik, 127206-Moscow

avkn@mail.ruДмитриеваН. В.DmitrievaN. V.

Дмитриева Наталья Владимировна - доктор медицинских наук, профессор, руководитель лаборатории микробиологической диагностики и лечения инфекций в онкологии, SPIN-код: 8217-2448.

115478, Москва, Каширское шоссе, 23

Natalia V. Dmitrieva - MD, DSc, Professor, Head of the Laboratory of Microbiological Diagnostics and Management of Infections in Cancer Patients, SPINcode: 8217-2448.

prof.ndmitrieva@mail.ruФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр онкологии им. Н.Н. Блохина» Минздрава РоссииРоссияN.N. Blokhin National Medical Research Cancer CenterRussian FederationФГБОУ ВО «Первый Московский государственный медицинский университет им. И.М. Сеченова» МЗ РФРоссияI.M. Sechenov First Moscow State Medical UniversityRussian FederationФГБОУ ВО «Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Н.И. Пирогова» МЗ РФРоссияN.I. Pirogov Russian National Research Medical UniversityRussian FederationФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр онкологии им. Н.Н. Блохина» Минздрава России; ГБПОУ ДЗМ Медицинский колледж № 1РоссияN.N. Blokhin National Medical Research Cancer Center; Medical college № 1Russian Federation2018030320181711118Copyright © Терещенко И.В., Григорьевская З.В., Петухова И.Н., Шильникова И.И., Григорьевский Е.Д., Терещенко О.В., Агинова В.В., Дмитриева Н.В., 20182018Терещенко И.В., Григорьевская З.В., Петухова И.Н., Шильникова И.И., Григорьевский Е.Д., Терещенко О.В., Агинова В.В., Дмитриева Н.В.Tereshchenko I.V., Grigorievskaya Z.V., Petukhova I.N., Shilnikova I.I., Grigorievsky Е.D., Tereshchenko О.V., Aginova V.V., Dmitrieva N.V.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.siboncoj.ru/jour/article/view/665

Микробиологическое исследование при помощи масс-спектрометрии на сегодняшний день является наиболее оптимальным и экономически обоснованным методом идентификации анаэробных микроорганизмов у онкологических больных. Наиболее проблемными в онкологической клинике были выявлены V. parvula, V. dispar и V. atypica. Все штаммы Veillonella spp. были чувствительны к имипенему. Однако отмечалась устойчивость анаэробных бактерий к препаратам группы пенициллинов, метронидазолу. Идентификация и определение чувствительности анаэробных микроорганизмов занимают достаточно много времени (7–10 дней). Распространение резистентных штаммов анаэробных микроорганизмов создаёт определенные проблемы при планировании эмпирических режимов терапии у онкологических больных. Необходим взвешенный подход к планированию эмпирической тактики при подозрении на наличие у больного анаэробной инфекции, поскольку неадекватные эмпирические режимы терапии существенно ухудшают прогноз. Нерациональное использование метронидазола ведет к продолжению нарастания резистентности среди анаэробных микроорганизмов.

We studied capabilities of the Bruker Microflex MALDI-TOF device for species identification of anaerobic gramnegative cocci isolated from clinical specimens of cancer patients. Seventy clinical isolates of Veillonella spp. and one Acidaminococcus spp were analyzed. All isolates were identified to the species level with a scores greater than 1.9. The most common species were V. parvula (37 strains), followed by V. dispar (16), V. atypical (16) and V. denticariosi (1). Susceptibilities of the isolates were determined by the E-test methodology. All Veillonella isolates were susceptible to imipenem, whereas high resistance rates were observed for penicillin G, amoxicillin/clavulanate and metronidazole. The proportion of resistant isolates of V. parvula, V. dispar and V. atypica to penicillin was 86 %, 85 % and 100 %, respectively. The resistance to amoxicillin/clavulanate was observed in 28.6 % of V. parvula isolates, 23.1 % of V. dispar isolates and in 6.7 % of V. atypica isolates. Resistance to metronidazole (MIC ≥ 8 µg/ml) of V. parvula, V. dispar and V. atypica was 88.6 %, 53.8 % and 40 %, respectively.

клинические изоляты Veillonella spp.грамотрицательные коккианаэробные инфекцииMALDI-TOF MSрезистентность к антибиотикамонкологические больныеVeillonella clinical Isolatesanaerobic InfectionsMALDI-TOF MSantimicrobial susceptibilitycancer patientsReferencesFinegold S.M., George W.L. Anaerobic infections in humans. Academic Press, New York, 1989.Finegold S.M., George W.L. Anaerobic infections in humans. Academic Press, New York, 1989.Давыдов М.И., Дмитриева Н.В. Инфекции в онкологии. М.: Практическая медицина, 2009. 55–86.Davydov М.I., Dmitrieva N.V. Infections in cancer patients. Мoscow: Practical Medicine, 2009. 55–86. [in Russian]Григорьевская З.В. Стратегия лечения нозокомиальных инфекций, вызванных резистентными микроорганизмами, в онкологической клинике [Дис. доктора мед.наук]. [Москва]; 2015. 252.Grigorievskaya Z.V. Treatment strategy for nosocomial infections caused by antibiotic-resistant pathogens in cancer patients [Doctoral thesis]. [Moscow]; 2015. 252. [in Russian]Fisher R.G., Denison M.R. Veillonella parvula bacteremia without underlying source. J Clin Microbiol. 1996 Dec; 34 (12): 3235–6.Fisher R.G., Denison M.R. Veillonella parvula bacteremia without underlying source. J Clin Microbiol. 1996 Dec; 34 (12): 3235–6.Liu J.W., Wu J.J., Wang L.R., Teng L.J., Huang T.C. Two fatal cases of Veillonella bacteremia. Eur J Clin Microbiol Infect Dis. 1998 Jan; 17 (1): 62–4.Liu J.W., Wu J.J., Wang L.R., Teng L.J., Huang T.C. Two fatal cases of Veillonella bacteremia. Eur J Clin Microbiol Infect Dis. 1998 Jan; 17 (1): 62–4.Strach M., Siedlar M., Kowalczyk D., Zembala M., Grodzicki T. Sepsis caused by Veillonella parvula infection in a 17-yearold patient with X-linked agammaglobulinemia (Bruton’s disease). J Clin Microbiol. 2006 Jul; 44 (7): 2655–6.Strach M., Siedlar M., Kowalczyk D., Zembala M., Grodzicki T. Sepsis caused by Veillonella parvula infection in a 17-yearold patient with X-linked agammaglobulinemia (Bruton’s disease). J Clin Microbiol. 2006 Jul; 44 (7): 2655–6.Boo T.W., Cryan B., O’Donnell A., Fahy G. Prosthetic valve endocarditis caused Veillonella parvula. J Infect. 2005 Jan; 50 (1): 81–3.Boo T.W., Cryan B., O’Donnell A., Fahy G. Prosthetic valve endocarditis caused Veillonella parvula. J Infect. 2005 Jan; 50 (1): 81–3.Marriott D., Stark D., Harkness J. Veillonella parvula discitis and secondary bacteremia: a rare infection complicating endoscopy and colonoscopy? J Clin Microbiol. 2007 Feb; 45 (2): 672–4.Marriott D., Stark D., Harkness J. Veillonella parvula discitis and secondary bacteremia: a rare infection complicating endoscopy and colonoscopy? J Clin Microbiol. 2007 Feb; 45 (2): 672–4.Bhatti M.A., Frank M.O. Veillonella parvula meningitis: case report and review of Veillonella infections. Clin Infect Dis. 2000 Sep; 31 (3): 839–40.Bhatti M.A., Frank M.O. Veillonella parvula meningitis: case report and review of Veillonella infections. Clin Infect Dis. 2000 Sep; 31 (3): 839–40.Shah A., Panjabi C., Nair V., Chaudhry R., Thukral S.S. Veillonella as a cause of chronic anaerobic pneumonitis. Int J Infect Dis. 2008 Nov; 12 (6): e115–7. doi: 10.1016/j.ijid.2008.03.018.Shah A., Panjabi C., Nair V., Chaudhry R., Thukral S.S. Veillonella as a cause of chronic anaerobic pneumonitis. Int J Infect Dis. 2008 Nov; (6): e115–7. doi: 10.1016/j.ijid.2008.03.018.Marchandin H., Teyssier C., de Buochberg M.S., Jean-Pierre H., Carriere C., Jumas-Bilak E. Intra-chromosomal heterogeneity between the four 16S rRNA gene copies in the genus Veillonella: implications for phylogeny and taxonomy. Microbiology. 2003, 149: 1493–1501.Marchandin H., Teyssier C., de Buochberg M. S., Jean-Pierre H., Carriere C., Jumas-Bilak E. Intra-chromosomal heterogeneity between the four 16S rRNA gene copies in the genus Veillonella: implications for phylogeny and taxonomy. Microbiology. 2003, 149: 1493–1501.Mashima I., Nakazawa F. Identification of Veillonella to be tsuensis in tongue biofilm by using a species-specific primer pair. Anaerobe. 2013 Aug; 22: 77–81. doi: 10.1016/j.anaerobe.2013.04.015Mashima I., Nakazawa F. Identification of Veillonella to be tsuensis in tongue biofilm by using a species-specific primer pair. Anaerobe. 2013 Aug; 22: 77–81. doi: 10.1016/j.anaerobe.2013.04.015Kostrzewa M. MALDI-TOF mass spectrometry in microbiology. Caister Academic Press, 2016. 200.Kostrzewa M. MALDI-TOF mass spectrometry in microbiology. Caister Academic Press, 2016. 200.Justesen U.S., Holm A., Knudsen E., Andersen L.B., Jensen T.G., Kemp M., Skov M.N., Gahrn-Hansen B., Møller J.K. Species identification of clinical isolates of anaerobic bacteria: a comparison of two matrix assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry systems. J Clin Microbiol. 2011 Dec; 49 (12): 4314–8. doi: 10.1128/JCM.05788-11.Justesen U.S., Holm A., Knudsen E., Andersen L.B., Jensen T.G., Kemp M., Skov M.N., Gahrn-Hansen B., Møller J.K. Species identification of clinical isolates of anaerobic bacteria: a comparison of two matrix assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry systems. J Clin Microbiol. 2011 Dec; 49 (12): 4314–8. doi: 10.1128/JCM.05788-11.Fournier R., Wallet F., Grandbastien B., Dubreuil L., Courcol R., Neut C., Dessein R. Chemical extraction versus direct smear for MALDITOF mass spectrometryidentification of anaerobic bacteria. Anaerobe. 2012, 18: 294–297. doi: 10.1016/j.anaerobe.2012.03.008.Fournier R., Wallet F., Grandbastien B., Dubreuil L., Courcol R., Neut C., Dessein R. Chemical extraction versus direct smear for MALDITOF mass spectrometryidentification of anaerobic bacteria. Anaerobe. 2012, 18: 294–297. doi: 10.1016/j.anaerobe.2012.03.008.Barreau M., Pagnier I., La Scola B. Improving the identification of anaerobes in the clinical microbiology laboratory through MALDITOF mass spectrometry. Anaerobe. 2013 Aug; 22: 123–5. doi: 10.1016/j.anaerobe.2013.04.011.Barreau M., Pagnier I., La Scola B. Improving the identification of anaerobes in the clinical microbiology laboratory through MALDITOF mass spectrometry. Anaerobe. 2013 Aug; 22: 123–5. doi: 10.1016/j.anaerobe.2013.04.011.Fedorko D.P., Drake S.K., Stock F., Murray P.R. Identification of clinical isolates of anaerobic bacteria using matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry. Eur J Clin Microbiol Infect Dis. 2012 Sep; 31 (9): 2257–62. doi: 10.1007/s10096-012-1563-4.Fedorko D.P., Drake S.K., Stock F., Murray P.R. Identification of clinical isolates of anaerobic bacteria using matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry. Eur J Clin Microbiol Infect Dis. 2012 Sep; 31 (9): 2257–62. doi: 10.1007/s10096-012-1563-4.Schmitt B.H., Cunningham S.A., Dailey A.L., Gustafson D.R., Patel R. Identification of anaerobic bacteria by Bruker Biotyper matrixassisted laser desorption ionizationtime of flight mass spectrometry with on-plate formic acid preparation. J Clin Microbiol. 2013 Mar; 51 (3): 782–6. doi: 10.1128/JCM.02420-12.Schmitt B.H., Cunningham S.A., Dailey A.L., Gustafson D.R., Patel R. Identification of anaerobic bacteria by Bruker Biotyper matrixassisted laser desorption ionizationtime of flight mass spectrometry with on-plate formic acid preparation. J Clin Microbiol. 2013 Mar; 51 (3): 782–6. doi: 10.1128/JCM.02420-12.Veloo A.C., Elgersma P.E., Friedrich A.W., Nagy E., van Winkelhoff A.J. The influence of incubation time, sample preparation and exposure to oxygen on the quality of theMALDI-TOF MS spectrum of anaerobic bacteria. Clin Microbiol Infect. 2014 Dec; 20 (12): O1091–7. doi: 10.1111/1469-0691.12644.Veloo A.C., Elgersma P.E., Friedrich A.W., Nagy E., van Winkelhoff A.J. The influence of incubation time, sample preparation and exposure to oxygen on the quality of theMALDI-TOF MS spectrum of anaerobic bacteria. Clin Microbiol Infect. 2014 Dec; 20 (12): O1091–7. doi: 10.1111/1469-0691.12644.Определитель бактерий Берджи. В 2 т. М.: Мир, 1997. Т. 1. 432.Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology. Vol. 1. Moscow, 1997. 432. [in Russian]Brook I. Veillonella infections in children. J Clin Microbiol. 1996 May; 34 (5): 1283–5.Brook I. Veillonella infections in children. J Clin Microbiol. 1996 May; 34 (5): 1283–5.Reig M., Mir N., Baquero F. Penicillin resistancein Veillonella. Antimicrob Agents Chemother. 1997 May; 41 (5): 1210.Reig M., Mir N., Baquero F. Penicillin resistancein Veillonella. Antimicrob Agents Chemother. 1997 May; 41 (5): 1210.Nyfors S., Könönen E., Bryk A., Syrjänen R., Jousimies-Somer H. Age-related frequency of penicillin resistance of oral Veillonella. Diagn Microbiol Infect Dis. 2003 Aug; 46 (4): 279–83.Nyfors S., Könönen E., Bryk A., Syrjänen R., Jousimies-Somer H. Age-related frequency of penicillin resistance of oral Veillonella. Diagn Microbiol Infect Dis. 2003 Aug; 46 (4): 279–83.Ready D., Bedi R., Mullany P., Wilson M. Penicillin and amoxicillin resistance in oral Veillonella spp. Int J Antimicrob Agents. 2012 Aug; 40 (2): 188–9. doi: 10.1016/j.ijantimicag.2012.04.007.Ready D., Bedi R., Mullany P., Wilson M. Penicillin and amoxicillin resistance in oral Veillonella spp. Int J Antimicrob Agents. 2012 Aug; 40 (2): 188–9. doi: 10.1016/j.ijantimicag.2012.04.007.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.