Шаманин Владимир Александрович, кандидат биологических наук, старший научный сотрудник, Федеральный исследовательский центр фундаментальной и трансляционной медицины
630117, г. Новоcибирск, ул. Тимакова, 2
SPIN-код: 5669-0201. AuthorID (РИНЦ): 477135
Vladimir A. Shamanin, PhD, Senior Researcher, Federal Research Center for Fundamental and Translational Medicine
2, Timakova Street, 630117-Novosibirsk
Карпов Игорь Владимирович, лаборант, Федеральный исследовательский центр фундаментальной и трансляционной медицины
630117, г. Новоcибирск, ул. Тимакова, 2,
Igor V. Karpov, Laboratory assistant, Federal Research Center for Fundamental and Translational Medicine
2, Timakova Street, 630117-Novosibirsk
Гервас Полина Анатольевна, кандидат медицинских наук, научный сотрудник
634009, г. Томск, пер. Кооперативный, 5
SPIN-код: 2934-7970. AuthorID (РИНЦ): 183827
Polina A. Gervas, PhD, Research Fellow
5, Kooperativny Street, 634009-Tomsk
Чердынцева Надежда Викторовна, доктор биологических наук, профессор, член-корреспондент РАН, заместитель директора по научной работе, заведующая лабораторией молекулярной онкологии и иммунологии
634009, г. Томск, пер. Кооперативный, 5
SPIN-код: 5344-0990. AuthorID (РИНЦ): 81344. ResearcherID (WOS): C-7943-2012. Author ID (Scopus): 6603911744
Nadezhda V. Cherdyntseva, DSc, Professor, Corresponding Member of the Russian Academy of Sciences, Head of the Laboratory of Molecular Oncology and Immunology
5, Kooperativny Street, 634009-Tomsk
ResearcherID (WOS): C-7943-2012. Author ID (Scopus): 6603911744
Симолина Елена Ивановна, кандидат медицинских наук, научный сотрудник отделения химиотерапии
634009, г. Томск, пер. Кооперативный, 5
SPIN-код: 9579-0549
Elena I. Simolina, MD, PhD, Researcher, Department of Chemotherapy
5, Kooperativny Street, 634009-Tomsk
Козлов Вадим Викторович, кандидат медицинских наук, заведующий онкологическим отделением № 3
630108, г. Новосибирск, ул. Плахотного, 2
Vadim V. Kozlov, MD, PhD, Head of Oncology Department № 3
2, Plahotnogo Street, 630108-Novosibirsk
Коваленко Сергей Петрович, доктор биологических наук, руководитель лаборатории, Федеральный исследовательский центр фундаментальной и трансляционной медицины
630117, г. Новоcибирск, ул. Тимакова, 2
SPIN-код: 22726747. AuthorID (РИНЦ): 92420
Sergey P. Kovalenko, DSc, Head of Laboratory, Federal Research Center for Fundamental and Translational Medicine
2, Timakova Street, 630117-Novosibirsk
Активирующие мутации гена EGFR связаны с чувствительностью немелкоклеточного рака легкого (НМКРЛ) к ингибиторам тирозинкиназ (ИТК). Жидкостная биопсия с использованием циркулирующей внеклеточной опухолевой ДНК (цоДНК) предлагается в случаях, когда опухолевая ткань недоступна, а также для мониторинга статуса гена EGFR. В данном исследовании мы опробовали новый метод на основе количественной ПЦР (кПЦР) для выявления мутаций гена EGFR в цоДНК плазмы. Чувствительность метода составила 1 % мутантного аллеля EGFR L858R, L861Q, S768I и делеций экзона 19 и 5 % мутантного аллеля EGFR G719X или T790M. В плазме крови, взятой до операции, мутации были выявлены в 4 из 7 (57 %) случаев с мутацией гена EGFR в ткани опухоли. При этом в двух случаях мутации в цоДНК полностью соответствовали мутациям, которые были обнаружены в ткани опухоли. В одном случае при наличии мутаций G719X и S768I в ткани опухоли только S768I была выявлена в цоДНК. Еще в одном случае мутация T790M была выявлена в плазме дополнительно к мутации L858R, которая была в ткани опухоли. Мутации гена EGFR не были обнаружены в ДНК плазмы крови 12 здоровых доноров и 13 больных НМКРЛ, имевших ген EGFR дикого типа, что означает 100 % специфичность теста. Жидкостная биопсия выявила мутации EGFR в 8 из 16 случаев НМКРЛ, которые несли мутации гена EGFR и проходили курс терапии с использованием ИТК. В этой группе в 7 случаях мутации в жидкой биопсии соответствовали тем, которые были в опухолевой ткани, а еще в одном случае мутация T790M была выявлена дополнительно к мутации L858R. В 3 случаях увеличение частоты мутантного аллеля было выявлено за 2–12 мес до клинической прогрессии.
Activating mutations of EGFR are associated with sensitivity of non-small cell lung cancer (NSCLC ) to tyrosine kinase inhibitors (TKI). Liquid biopsy using circulating cell-free tumor DNA (cfDNA) is proposed in cases when formalin fixed paraffin embedded (FFPE) tumor tissue is not available and for monitoring of EGFR status. In the study we evaluated new qPC R assay for EGFR mutations in plasma cfDNA. Sensitivity of the assay was 1 % of the mutant allele for L858R, L861Q, S768I mutations and deletions in exon 19, and 5 % of the mutant allele for G719X or T790M mutations Before surgery, mutation was detected in plasma of 4 out of 7 patients (57 %) with mutant EGFR in FFPE tumor tissue. Mutations found in cfDNA completely matched those found in tumor tissue in 2 cases. In one case with G719X and S768I mutations in FFPE tissue, only S768I was found in cfDNA. In another case, T790M was detected in plasma in addition to L858R that was present in tumor tissue. No EGFR mutations were detected in plasma DNA from 12 healthy volunteers and 13 cases of NSCLC with wt EGFR suggesting 100 % specificity of the assay. Liquid biopsy detected EGFR mutations in cfDNA in 8 of 16 cases of NSCLC with mutant EGFR being under therapy with TKI. Among them, 7 cases had mutations in liquid biopsy that matched those in tumor tissue and another case had T790M in addition to L858R. In 3 cases increased mutant allele frequency was detected 212 months before clinical progression.
The authors declare that there are no conflicts of interest present.