Перспективные технологии молекулярно-генетической диагностики у пациентов с протоковой аденокарциномой поджелудочной железы

Цель исследования – оценка диагностических и прогностических возможностей технологии QClamp™ real-time ПЦР для выявления цоДНК с мутациями гена KRAS у пациентов с протоковой аденокарциномой поджелудочной железы.
Материал и методы. В исследование включено 119 пациентов с различной распространенностью рака поджелудочной железы (РПЖ). Из плазмы крови выделяли внеклеточную ДНК и проводили детекцию наиболее распространенных соматических мутаций KRAS с использованием XNA-опосредованного подавления амплификации дикого типа.
Результаты. Мутации KRAS в плазме крови выявлены у 23,5 % пациентов, при этом частота обнаружения цоДНК возрастала с прогрессированием заболевания и достигала при местнораспространенном РПЖ – 66,7 % и при метастатическом – 25,0 %. У больных с резектабельными стадиями (I–II) рака поджелудочной железы цоДНК выявлялась в 15,6 % случаев, однако ее наличие было ассоциировано с достоверно худшей общей и безрецидивной выживаемостью. Концентрация общей внеклеточной ДНК существенно варьировала и не коррелировала напрямую со стадией заболевания, что подтверждает ограниченную информативность этого показателя без молекулярного анализа.
Заключение. Полученные данные свидетельствуют, что QClamp™ ПЦР является быстрым и технически выполнимым методом детекции цоДНК, обладающим высокой специфичностью. Наибольшее клиническое применение технология может иметь в прогнозировании течения заболевания и мониторинге минимальной остаточной болезни после хирургического лечения, дополняя существующие клинико-инструментальные подходы.

1. Siegel R.L., Miller K.D., Jemal A. Cancer statistics, 2020. CA Cancr J Clin. 2020; 70(1): 7–30. doi: 10.3322/caac.21590.

2. Bettegowda C., Sausen M., Leary R.J., Kinde I., Wang Y., Agrawal N., Bartlett B.R., Wang H., Luber B., Alani R.M., Antonarakis E.S., Azad N.S., Bardelli A., Brem H., Cameron J.L., Lee C.C., Fecher L.A., Gallia G.L., Gibbs P., Le D., Giuntoli R.L., Goggins M., Hogarty M.D., Holdhoff M., Hong S.M., Jiao Y., Juhl H.H., Kim J.J., Siravegna G., Laheru D.A., Lauricella C., Lim M., Lipson E.J., Marie S.K., Netto G.J., Oliner K.S., Olivi A., Olsson L., Riggins G.J., Sartore-Bianchi A., Schmidt K., Shih L.M., ObaShinjo S.M., Siena S., Theodorescu D., Tie J., Harkins T.T., Veronese S., Wang T.L., Weingart J.D., Wolfgang C.L., Wood L.D., Xing D., Hruban R.H., Wu J., Allen P.J., Schmidt C.M., Choti M.A., Velculescu V.E., Kinzler K.W., Vogelstein B., Papadopoulos N., Diaz L.A. Jr. Detection of circulating tumor DNA in early- and late-stage human malignancies. Sci Transl Med. 2014; 6(224): 224ra24. doi: 10.1126/scitranslmed.3007094.

3. Theparee T., Akroush M., Sabatini L.M., Wang V., Mangold K.A., Joseph N., Stocker S.J., Freedman A., Helseth D.L., Talamonti M.S., Kaul K.L. Cell free DNA in patients with pancreatic adenocarcinoma: clinicopathologic correlations. Sci Rep. 2024; 14(1): 15744. doi: 10.1038/s41598-024-65562-8.

4. Strobel O., Neoptolemos J.P., Jäger D., Büchler M.W. Optimizing the outcomes of pancreatic cancer surgery. Nat Rev Clin Oncol. 2019; 16(1): 11–26. doi: 10.1038/s41571-018-0112-1.

5. Cicenas J., Kvederaviciute K., Meskinyte I., Meskinyte-Kausiliene E., Skeberdyte A., Cicenas J.Jr. KRAS, TP53, CDKN2A, SMAD4, BRCA1, and BRCA2 Mutations in Pancreatic Cancer. Cancers (Basel). 2017; 9(5): 42. doi: 10.3390/cancers9050042.

6. Zill O.A., Greene C., Sebisanovic D., Siew L.M., Leng J., Vu M., Hendifar A.E., Wang Z., Atreya C.E., Kelley R.K., van Loon K., Ko A.H., Tempero M.A., Bivona T.G., Munster P.N., Talasaz A., Collisson E.A. Cell-free DNA next-generation sequencing in pancreatobiliary carcinomas. Cancer Discov. 2015; 5(10): 1040–48. doi: 10.1158/2159-8290. CD-15-0274.

7. Pietrasz D., Pécuchet N., Garlan F., Didelot A., Dubreuil O., Doat S., Imbert-Bismut F., Karoui M., Vaillant J.C., Taly V., Laurent-Puig P., Bachet J.B. Plasma circulating tumor DNA in pancreatic cancer patients is a prognostic marker. Clin Cancer Res. 2017; 23(1): 116–23. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-16-0806.

8. Strijker M., Soer E.C., de Pastena M., Creemers A., Balduzzi A., Beagan J.J., Busch O.R., van Delden O.M., Halfwerk H., van Hooft J.E., van Lienden K.P., Marchegiani G., Meijer S.L., van Noesel C.J., Reinten R.J., Roos E., Schokker S., Verheij J., van de Vijver M.J., Waasdorp C., Wilmink J.W., Ylstra B., Besselink M.G., Bijlsma M.F., Dijk F., van Laarhoven H.W. Circulating tumor DNA quantity is related to tumor volume and both predict survival in metastatic pancreatic ductal adenocarcinoma. Int J Cancer. 2020; 146(5): 1445–56. doi: 10.1002/ijc.32586.

9. Sivapalan L., Thorn G.J., Gadaleta E., Kocher H.M., Ross-Adams H., Chelala C. Longitudinal profling of circulating tumour DNA for tracking tumour dynamics in pancreatic cancer. BMC Cancer. 2022; 22(1): 369. doi: 10.1186/s12885-022-09387-6.

10. Kitahata Y., Kawai M., Hirono S., Okada K.I., Miyazawa M., Motobayashi H., Ueno M., Hayami S., Miyamoto A., Yamaue H. Circulating Tumor DNA as a Potential Prognostic Marker in Patients with BorderlineResectable Pancreatic Cancer Undergoing Neoadjuvant Chemotherapy Followed by Pancreatectomy. Ann Surg Oncol. 2022; 29(3): 1596–605. doi: 10.1245/s10434-021-10985-0.

11. Cohen J.D., Li L., Wang Y., Thoburn C., Afsari B., Danilova L., Douville C., Javed A.A., Wong F., Mattox A., Hruban R.H., Wolfgang C.L., Goggins M.G., Dal Molin M., Wang T.L., Roden R., Klein A.P., Ptak J., Dobbyn L., Schaefer J., Silliman N., Popoli M., Vogelstein J.T., Browne J.D., Schoen R.E., Brand R.E., Tie J., Gibbs P., Wong H.L., Mansfeld A.S., Jen J., Hanash S.M., Falconi M., Allen P.J., Zhou S., Bettegowda C., Diaz L.A. Jr., Tomasetti C., Kinzler K.W., Vogelstein B., Lennon A.M., Papadopoulos N. Detection and localization of surgically resectable cancers with a multi-analyte blood test. Science. 2018; 359(6378): 926–30. doi: 10.1126/science.aar3247.

12. Diaz L.A.Jr., Bardelli A. Liquid biopsies: genotyping circulating tumor DNA. J Clin Oncol. 2014; 32(6): 579–86. doi: 10.1200/JCO.2012.45.2011.