СПЕКТР МУТАЦИЙ ГЕНА BRCA1 У БОЛЬНЫХ РАКОМ МОЛОЧНОЙ ЖЕЛЕЗЫ В МОЛОДОМ ВОЗРАСТЕ В РОССИИ

Цель исследования – оценить частоту встречаемости патогенных мутаций в BRCA1 гене у женщин с раком молочной железы, проживающих в России.

Материал и методы. Проведён анализ полной кодирующей части гена BRCA1 у 445 больных раком молочной  железы на ранней стадии (возраст больных до 40 лет), проживающих в Новосибирской области (Россия), с  помощью метода таргетного секвенирования на платформе Ion Torrent. Результаты. Выявлено 40 (9 %)  носительниц различных патогенных мутаций. У 35 (7,9 %) пациенток обнаружена мутация 5382insC, описанная  ранее как «мутация-основателя» в славянской популяции. У 5 (1,1 %) пациенток были выявлены  другие различные патогенные мутации, а именно C61G, 462delCC, E143X, 4153delA и IVS18 + 1G> T. Кроме  того, 29 генетических вариантов с отсутствующей или неясной клинической значимостью были обнаружены в  гене BRCA1 у 445 больных раком молочной железы на ранней стадии. Выводы. Получены данные о частоте  генетических вариаций гена BRCA1 у больных раком молочной железы на ранней стадии, проживающих в  Новосибирской области (Россия). Доля мутации 5382insC составляет 87,5 % от всех патогенных мутаций в гене BRCA1, обнаруженных у пациенток.

1. Mavaddat N., Antoniou A.C., Easton D.F., Garcia-Closas M. Genetic susceptibility to breast cancer. Mol Oncol. 2010 Jun; 4(3): 174–91. doi: 10.1016/j.molonc.2010.04.011.

2. Fischer C., Kuchenbäcker K., Engel C., Zachariae S., Rhiem K., Meindl A., Rahner N., Dikow N., Plendl H., Debatin I., Grimm T., Gadzicki D., Flöttmann R., Horvath J., Schröck E., Stock F., Schäfer D., Schwaab I., Kartsonaki C., Mavaddat N., Schlegelberger B., Antoniou A.C., Schmutzler R. German Consortium for Hereditary Breast and Ovarian Cancer. Evaluating the performance of the breast cancer genetic risk models BOADICEA, IBIS, BRCAPRO and Claus for predicting BRCA1/2 mutation carrier probabilities: a study based on 7352 families from the German Hereditary Breast and Ovarian Cancer Consortium. J Med Genet. 2013 Jun; 50(6): 360–7. doi: 10.1136/jmedgenet-2012-101415.

3. Gayther S.A., Harrington P., Russell P., Kharkevich G., Garkavtseva R.F., Ponder B.A.J. Frequently occurring germ-line mutations of the BRCA1 gene in ovarian cancer families from Russia. Am J Hum Genet. 1997 May; 60(5): 1239–42.

4. Sokolenko A.P., Mitiushkina N.V., Buslov K.G., Bit-Sava E.M., Iyevleva A.G., Chekmariova E.V., Kuligina E.Sh., Ulibina Y.M., Rozanov M.E., Suspitsin E.N., Matsko D.E., Chagunava O.L., Trofimov D.Y., Devilee P., Cornelisse C., Togo A.V., Semiglazov V.F., Imyanitov E.N. High frequency of BRCA1 5382insC mutation in Russian breast cancer patients. Eur J Cancer. 2006 Jul; 42(10): 1380–84. doi: 10.1016/j.ejca.2006.01.050.

5. Sokolenko A.P., Rozanov M.E., Mitiushkina N.V., Sherina N.Y., Iyevleva A.G., Chekmariova E.V., Buslov K.G., Shilov E.S., Togo A.V., Bit- Sava E.M., Voskresenskiy D.A., Chagunava O.L., Devilee P., Cornelisse C., Semiglazov V.F., Imyanitov E.N. Founder mutations in early onset, familial and bilateral breast cancer patients from Russia. Familial Cancer. 2007; 6(3): 281–6. doi: 10.1007/s10689-007-9120-5.

6. Kwon J.S., Gutierrez-Barrera A.M., Young D., Sun C.C., Daniels M.S., Lu K.H., Arun B. Expanding the criteria for BRCA mutation testing in breast cancer survivors. J Clin Oncol. 2010 Sep; 28(27): 4214–20. doi: 10.1200/JCO.2010.28.0719.

7. Iyevleva A.G., Suspitsin E.N., Kroeze K., Gorodnova T.V., Sokolenko A.P., Buslov K.G., Voskresenskiy D.A., Togo A.V., Kovalenko S.P., Stoep N.V., Devilee P., Imyanitov E.N. Non-founder BRCA1 mutations in Russian breast cancer patients. Cancer Lett. 2010 Dec 8; 298(2): 258–63. doi: 10.1016/j.canlet.2010.07.013.

8. Anisimenko M.S., Mitrofanov D.V., Chasovnikova O.B., Voevoda M.I., Kovalenko S.P. BRCA1 gene mutations frequency estimation by allelespecific real-time PCR of pooled genomic DNA samples. Breast. 2013 Aug; 22(4): 532–6. doi: 10.1016/j.breast.2012.12.007.

9. Schmieder R., Edwards R. Quality control and preprocessing of metagenomic datasets. Bioinformatics. 2011 Mar 15; 27(6): 863–4. doi: 10.1093/bioinformatics/btr026.

10. Li H., Durbin R. Fast and accurate short read alignment with Burrows-Wheeler transform. Bioinformatics. 2009 Jul; 25(14): 1754–60. doi: 10.1093/bioinformatics/btp324.

11. Li H., Handsaker B., Wysoker A., Fennell T., Ruan J., Homer N., Marth G., Abecasis G., Durbin R.; 1000 Genome Project Data Processing Subgroup. The Sequence Alignment/Map format and SAMtools. Bioinformatics. 2009 Aug 15; 25(16): 2078–9. doi: 10.1093/bioinformatics/btp352.

12. Paul G.A., Matyash N.A., Pisareva E.E., Anisimenko M.S., Kozyakov A.E., Kovalenko S.P. Detection of mutations related to hereditary cancer in relatives of breast cancer patients. Siberian Journal of Oncology. 2017; 16(4): 84–88. doi: 10.21294/1814- 4861-2017-16-4-84-88. [in Russian]

13. Ermolenko N.A., Boyarskikh U.A., Kechin A.A., Mazitova A.M., Khrapov E.A., Petrova V.D., Lazarev A.F., Kushlinskii N.E., Filipenko M.L. Massive Parallel Sequencing for Diagnostic Genetic Testing of BRCA Genes ‑ a Single Center Experience. Asian Pac J Cancer Prev. 2015; 16(17): 7935–41. doi: 10.7314/APJCP.2015.16.17.7935.

14. Bermisheva M.A., Zinnamullina G.F., Gantsev Sh.Kh., Kochanova V.A., Popov O.S., Dörk T., Khusnutdinova E.K. Frequency of 5382insC mutation of the BRCA1 gene. Vopr Onkol. 2008; 54(1): 31–3.

15. Gorodetska I., Serga S., Levkovich N., Lahuta T., Ostapchenko L., Demydov S., Anikusko N., Cheshuk V., Smolanka I., Sklyar S., Polenkov S., Boichenko O., Kozeretska I. The frequency of BRCA1 founder mutation c.5266dupC (5382insC) in breast cancer patients from Ukraine. Hered Cancer Clin Pract. 2015 Oct; 13: 19. doi: 10.1186/s13053-015-0040-3.

16. Brozek I., Ratajska M., Piatkowska M., Kluska A., Balabas A., Dabrowska M., Nowakowska D., Niwinska A., Rachtan J., Steffen J., Limon J. Limited significance of family history for presence of BRCA1 gene mutation in Polish breast and ovarian cancer cases. Fam Cancer. 2012 Sep; 11(3): 351–4. doi: 10.1007/s10689-012-9519-5.

17. Backe J., Hofferbert S., Skawran B., Dörk T., Stuhrmann M., Karstens J.H., Untch M., Meindl A., Burgemeister R., Chang-Claude J., Weber B.H. Frequency of BRCA1 mutation 5382insC in German breast cancer patients. Gynecol Oncol. 1999 Mar; 72(3): 402–6. doi: 10.1006/gyno.1998.5270.

18. Muller D., Bonaiti-Pellié C., Abecassis J., Stoppa-Lyonnet D., Fricker J.P. BRCA1 testing in breast and/or ovarian cancer families from northeastern France identifies two common mutations with a founder effect. Fam Cancer. 2004; 3(1): 15–20. doi: 10.1023/B:FAME.0000026819.44213.df.

19. de Juan Jiménez I., García Casado Z., Palanca Suela S., Esteban Cardeñosa E., López Guerrero J.A., Segura Huerta Á., Chirivella González I., Sánchez Heras A.B., Juan Fita M.J., Tena García I., Guillen Ponce C., Martínez de Dueñas E., Romero Noguera I., Salas Trejo D., Goicoechea Sáez M., Bolufer Gilabert P. Novel and recurrent BRCA1/ BRCA2 mutations in early onset and familial breast and ovarian cancer detected in the Program of Genetic Counseling in Cancer of Valencian Community (eastern Spain). Relationship of family phenotypes with mutation prevalence. Fam Cancer. 2013 Dec; 12(4): 767–77. doi: 10.1007/s10689-013-9622-2.